Jame kaupiami laivų brėžiniai, jūrininkų ir kitų žmonių, susijusių su jūra, atsiminimai, moksliniai tiriamieji darbai, ekspozicijų ir parodų koncepcijos, planai, vaizdo ir garso įrašai, fototeka. Archyvo aprašas skelbiamas Lietuvos muziejų internetiniame portale http://www.muziejai.lt/archyvai/archyvai_muziejuose.htm. Didelę šio archyvo dalį sudaro muziejaus komplekso statybos, plėtros ir rekonsrukcijų techninė dokumentacija. Bylų aprašai pradėtitalpinti  LIMIS duomenų bazėje.