Rinkinyje yra apie 2000 pagrindinio ir pagalbinio fondų įvairių eksponatų. Tai – jūrinių organizacijų ir laivų vėliavos, karinio laivyno (tarpukario Lietuvos, sovietinio laikotarpio, Lietuvos karinių jūrų pajėgų) jūrininkų uniformos, sudarančios tekstilės rinkinį. Kita dalis – suvenyrai, memorialiniai daiktai, sportiniai prizai ir kt. Jie eksponuojami, skolinami parodoms, suskaitmeninti daiktai pateikti LIMIS viešai prieigai.